一、产品概述
(一)产品主要组成成分

产品主要组成成分见表1:
表1 试剂盒主要组成成分
名称 | 组分 | 主要组成成分 | 24测试装量 | 36 测试装量 | 48 测试装量 | 数量 |
试剂盒Ⅰ | 片段化混合酶 | DNA限制性内切酶 | 120μL/管 | 180μL/管 | 240μL/管 | 1管 |
片段化缓冲液 | Tris-HCl,MgCl2, DTT | 60μL/管 | 90μL/管 | 120μL/管 | 1管 | |
末修混合酶 | DNA聚合酶,多聚核苷酸激酶 | 36μL/管 | 54μL/管 | 72μL/管 | 1管 | |
末修缓冲液 | Tris-HCl,MgCl2, DTT,dNTPs | 84μL/管 | 126μL/管 | 168μL/管 | 1管 | |
连接酶 | DNA连接酶 | 120μL/管 | 180μL/管 | 240μL/管 | 1管 | |
连接缓冲液 | Tris-HCl,MgCl2, DTT,PEG6000 | 360μL/管 | 540μL/管 | 720μL/管 | 1管 | |
接头 | 核苷酸序列 | 120μL/管 | 180μL/管 | 240μL/管 | 1管 | |
PCR扩增预混液 | DNA聚 合酶 , dNTPs,MgCl2 | 300μL/管 | 450μL/管 | 600μL/管 | 1管 | |
101、102…112 | 核苷酸序列 | 7.5μL/管 | 10μL/管 | 12.5μL/管 | 八联排管×1 四联排管×1 | |
201、202…208 | 核苷酸序列 | 10μL/管 | 12.5μL/管 | 17.5μL/管 | 八联排管×1 | |
阴性质控品 | DA0050细胞系gDNA | 10μL/管 | 10μL/管 | 10μL/管 | 1管 | |
阳性质控品 | RT4细胞系gDNA | 10μL/管 | 10μL/管 | 10μL/管 | 1管 | |
试剂盒Ⅱ | 纯化磁珠 | 磁珠,缓冲液 | 800μL/管 | 1200μL/管 | 1600μL/管 | 2管 |
(二)产品预期用途
本产品用于体外定性检测尿液样本中的染色体臂1q、3q、7p、7q、8q、17q的重复及染色体臂9p、9q、17p的缺失。
本产品适用于疑似尿路上皮癌初诊患者的辅助诊断。
本产品适用于有血尿、膀胱刺激症等临床症状,或经影像学等非侵入性方法显示异常,临床可能需进一步检查的疑似尿路上皮癌初诊患者的辅助诊断,尤其是经影像学等非侵入性方法无法决策病例是否开展膀胱镜检查的辅助诊断。可为患者提供一种尿路上皮癌的无创辅助诊断选择,但不能作为肿瘤早期诊断或确诊的依据。临床医生应结合患者病情及其它实验室检测指标等因素对检测结果开展综合判断。
(三)产品包装规格
24测试/盒、36测试/盒、48测试/盒。
(四)产品检验原理
本试剂盒适用于Gene+Seq-200高通量测序平台的测序文库构建,包括待测样本的文库构建试剂及阴、阳性质控品,用于检测过程中试剂与仪器的质量控制。
,提取待检测的尿液样本中脱落细胞的基因组DNA,然后片段化处理,对所得片段开展末修加A处理,使用DNA连接酶将接头连接到DNA模板的两端,再使用带有标签序列的引物与聚合酶开展PCR扩增得到扩增文库,通过Gene+Seq-200高通量测序
得到测序数据,通过配套的生物信息数据研究软件研究后获得待测样本的染色体拷贝数变异信息。
二、临床前研究概述
(一)主要原材料
1.主要原材料的选择
试剂盒主要原材料包括DNA限制性内切酶、DNA聚合酶、多聚核苷酸激酶、DNA连接酶、接头、PCR引物、磁珠、阴性质控品(DA0050细胞系gDNA)与阳性质控品(RT4细胞系gDNA)等。主要原材料均为外购,接头与PCR引物为申请人自行设计后委托第三方公司合成。通过功能性试验,申请人筛选出最佳原材料与供应商,同时制定了各主要原材料质量标准并经检验合格。
2.企业参考品与对照品的设置情况
企业参考品包括阴性参考品、阳性参考品、最低检测限参考品与重复性参考品。阴性参考品:10份,由该试剂盒所有检测靶标为阴性的人源细胞系DNA与泌尿系统良性疾病(内含内源干扰因素)、其他恶性肿瘤以及健康人样本DNA组成。阳性参考品:
6份,涵盖该试剂盒所有检测靶标,由人源细胞系DNA制成。最低检测限参考品:9份,由涵盖该试剂盒所有检测靶标的临床样本或人源细胞系DNA制备而成。重复性参考品:4份,由涵盖该试剂盒所有检测靶标的人源细胞系DNA以及所有检测靶标阴性的人源细胞系DNA组成。
试剂盒配套阴、阳性质控品用于检测过程中试剂与仪器的质量控制。
(二)生产工艺及反应体系研究
申请人对试剂盒反应体系的研究包括:样本提取用量、片段化混合酶加入量、片段化反应时间、末修混合酶加入量、末修加A反应时间、连接酶加入量、接头加入量、连接反应时间、PCR扩增预混液加入量、PCR引物用量、PCR循环数、磁珠用量、DNA投入量、测序反应体系、测序数据量研究等,最终确定了最佳的反应体系。
申请人按照试剂盒中试剂及组分的主要生产工艺的研究结果,确定了最佳的生产工艺。
(三)研究性能评估
本产品研究性能评估内容包括准确性、精密度、检出限、研究特异性(交叉反应与干扰物质研究)、核酸提取试剂性能研究。
1.准确性研究
准确性研究中申请人使用3批成品试剂盒在适用机型上对阳性参考品、阴性参考品分别开展检测,检测结果显示阴性参
考品符合率、阳性参考品符合率均为100%。同时申请人收集了若干例临床尿液样本对试剂盒准确性开展了研究,检测结果与基因芯片法检测结果开展比较,结果符合要求。
2.精密度研究
精密度研究中申请人在适用机型上通过不同批次内/间、试验日内/间、不同操作者间、不同仪器间、不同实验室间对阴性、多靶标弱阳性、单靶标弱阳性、单靶标中阳性样本开展精密度评价,结果显示试剂盒精密度性能符合要求。
3.检出限研究
检出限研究中申请人使用3批成品试剂盒,对不同浓度、不同变异比例的单靶标阳性细胞系或临床样本重复检测 20 次开展检出限的形成。用多例临床样本在检出限浓度水平上开展检出限的验证。结果表明本试剂盒的检出限为在5ngDNA背景下,10%的变异比例。
4.研究特异性研究
研究特异性研究开展了交叉反应与干扰物质研究。
在交叉反应研究中,对临床确诊为非尿路上皮癌的泌尿系统其他恶性肿瘤、非泌尿系统其他癌症、泌尿系统良性疾病样本以及血尿与非血尿样本开展检测;并对同一染色体区域其他变异类型、靶标染色体长臂/短臂的微缺失/重复、正常人以及潜在同源序列开展研究,结果均显示申报试剂盒无交叉反应。
干扰物质研究结果显示,尿液中含有以下干扰物质:细胞保存液(2%)、尿酸(0.6g/L)、氯化钠(9g/L)、血红蛋白(2g/L)、抗坏血酸(50mg/mL)、胆红素(2mg/mL)、酒精(1%)、大肠杆菌(1*106cfu/mL)、阿司匹林(3.3g/L)、白色念珠菌
(1*106cfu/mL)、金黄色葡萄球菌(1*106cfu/mL)、吉西他滨(2mg/mL)、吡柔比星(0.12mg/mL)、丝裂霉素(0.12mg/mL)、卡介苗(0.36mg/mL:3.6*105cfu/mL)对检测结果无影响。
5.核酸提取试剂研究
申请人按照基于临床样本对核酸提取试剂的提取效率、检出限、精密度与抗干扰能力开展了研究,结果表明本产品配套的提取试剂盒符合检测要求。
(四)阳性判断值研究
本试剂阳性判断值研究包括三部分,分别是参考数据库的研究、阳性判断值的确定与阳性判断值的验证。选择1025例非肿瘤人群形成了参考数据库。然后纳入 169 例尿路上皮癌患者、113例泌尿系统良性疾病以及其他肿瘤样本,按照基于ROC曲线研究与 99%特异性确定了本产品的阳性判断值。另外按照基于了256例临床样本对本产品的阳性判断值开展了验证,得到本产品的阳性判断值为:当Z值≥3.000 时,代表染色体臂重复,当Z值≤-3.000 时,代表染色体臂缺失,当-3.000<Z值<3.000 时,代表未出现染色体拷贝数变异。对于本产品,当待检测样本染色体臂1q、3q、7p、7q、8q、17q的Z值≥3.000与9p、9q、17p的Z值≤-3.000 中任一条件满足时,判断为阳性,否则判断为阴性。
(五)稳定性研究
申请人对产品的实时稳定性、运输稳定性、使用稳定性及样本稳定性开展了研究。
实时稳定性:将 3 批试剂盒置于规定储存条件下,分别于不同时间点使用企业参考品对试剂盒的性能开展检测,结果显示试剂盒在生产后保存至12 个月各项性能指标均符合产品技术要求,产品有效期可达10个月。
此外,申请人对产品的运输稳定性、使用稳定性与样本稳定性分别开展了研究。结果显示,产品的性能均能满足产品说明书的声称。
三、临床评价概述
申请人在海军军医大学第一附属医院、上海交通大学医学院附属仁济医院、西安交通大学第一附属医院、南京大学医学院附属鼓楼医院与上海市第一人民医院共五家临床机构完成了临床试验。按照基于试验体外诊断试剂与尿路上皮癌临床参考标准开展比较研究,对产品临床性能开展评价。入组病例包括:有血尿、膀胱刺激症等临床症状的病例,包括经影像学等非侵入性方法显示异常,临床需进一步检查的疑似尿路上皮癌初诊患者,以及经影像学等非侵入性方法无法决策是否开展膀胱镜检查的病例。样本类型为尿液样本。临床试验共入组受试者 1041 例,其中临床参考标准确认尿路上皮癌病例 423例(其中 0 期 124例、Ⅰ期159例、Ⅱ期55例、Ⅲ期65例、Ⅳ期 8例),非尿路上皮癌病例 618 例;临床确诊为尿路上皮癌的病例中包括膀胱癌294例,肾盂癌 66例、输尿管癌63例;入组病例包括肌层浸润性尿路上皮癌病例130例,非肌层浸润性尿路上皮癌289例;非尿路上皮癌包括泌尿系统良性疾病 403 例,泌尿系统的其他恶性肿瘤(肾癌与前列腺癌等)82例,泌尿系统外的其它恶性肿瘤133例等。
试验结果显示,本产品与临床参考标准相比的临床灵敏度为89.6%(95%CI:86.32%,92.16%),临床特异度为97.9%(95%CI:96.43%,98.77%)。
此外,临床试验还纳入 419 例疑似尿路上皮癌病例,按照基于试验体外诊断试剂与临床参考方法(NGS方法)开展比较研究,确认本产品的临床检测性能。试验结果显示:针对染色体臂1q重复,阳性病例共142例,阳性符合率为97.89%(95%CI:93.97%,99.28%),阴性符合率为98.56%(95%CI:96.35%,99.44%);针对染色体臂3q重复,阳性病例共135例,阳性符合率为97.04%(95%CI:92.63%,98.84%),阴性符合率为98.94%(95%CI:96.94%,99.64%);针对染色体臂7p重复,阳性病例共109例,阳性符合率为97.25%(95%CI:92.22%,99.06%),阴性符合率为98.39%(95%CI:96.28%,99.31%);针对染色体臂7q重复,阳性病例共 104 例,阳性符合率为 99.04%(95%CI:94.75%,99.83%),阴性符合率为98.41%(95%CI:96.34%,99.32%);针对染色体臂8q重复,阳性病例共146例,阳性符合率为98.63%(95%CI:95.14%,99.62%),阴性符合率为97.44%(95%CI:94.80%,98.75%);针对染色体臂9p缺失,阳性病例共114例,阳性符合率为97.37%(95%CI:92.55%,99.10%),阴性符合率为99.34%(95%CI:97.64%,99.82%);针对染色体臂9q缺失,阳性病例共 138 例,阳性符合率为 99.28%(95%CI:96.01%,99.87%),阴性符合率为97.15%(95%CI:94.48%,98.55%);针对染色体臂17p缺失,阳性病例共114例,阳性符合率为97.37%(95%CI:92.55%,99.10%),阴性符合率为98.69%(95%CI:96.68%,99.49%);针对染色体臂17q重复,阳性病例共102例,阳性符合率为97.06%(95%CI:91.71%,98.99%),阴性符合率为98.74%(95%CI:96.80%,99.51%)。上述结果显示两者之间具有良好的一致性,本产品临床检测性能满足要求。
另外,按照基于试验体外诊断试剂对61例尿路上皮癌患者手术前后的样本开展连续检测,52例样本术前检测结果为阳性,其中47例术后检测结果为阴性;9例样本术前术后检测结果均为阴性,表明尿路上皮癌手术切除后尿液中被测物水平减少。
,该产品临床试验设计符合《体外诊断试剂临床试验技术指导原则》的相关要求,产品临床性能满足技术审评要求。
四、产品受益风险判定
按照 GB/T 42062-2022《医疗器械 风险管理对医疗器械的应用》对尿路上皮癌染色体异常检测试剂盒(联合探针锚定聚合测序法)开展产品受益风险判定。
(一)受益评估
本产品用于体外定性检测尿液样本中的染色体臂1q、3q、7p、7q、8q、17q的重复及染色体臂9p、9q、17p的缺失。
本产品适用于疑似尿路上皮癌初诊患者的辅助诊断。
本产品适用于有血尿、膀胱刺激症等临床症状,或经影像学等非侵入性方法显示异常,临床可能需进一步检查的疑似尿路上皮癌初诊患者的辅助诊断,尤其是经影像学等非侵入性方法无法决策病例是否开展膀胱镜检查的辅助诊断。可为患者提供一种尿路上皮癌的无创辅助诊断选择,但不能作为肿瘤早期诊断或确诊的依据。临床医生应结合患者病情及其它实验室检测指标等因素对检测结果开展综合判断。
(二)风险评估
申请人对已知危险(源)开展风险评价,按照风险可接受准则判断每个危险(源)的风险是否达到可接受水平,对可靠可行减少的风险、不经过风险/收益研究既判定为不可接受的风险采取控制措施,并对具体措施开展实施验证,同时重新对采取措施后的风险开展估计,确认其风险水平是否可接受。
尽管目前认为该试剂盒的受益相较而言更多风险,但为保证用械安全,基于对主要剩余风险的防控,已在该试剂盒说明书中提示以下信息:
1.预期用途:本产品用于体外定性检测尿液样本中的染色体臂1q、3q、7p、7q、8q、17q的重复及染色体臂9p、9q、17p的缺失。
本产品适用于疑似尿路上皮癌初诊患者的辅助诊断。
本产品适用于有血尿、膀胱刺激症等临床症状,或经影像学等非侵入性方法显示异常,临床可能需进一步检查的疑似尿路上皮癌初诊患者的辅助诊断,尤其是经影像学等非侵入性方法
无法决策病例是否开展膀胱镜检查的辅助诊断。可为患者提供一种尿路上皮癌的无创辅助诊断选择,但不能作为肿瘤早期诊断或确诊的依据。临床医生应结合患者病情及其它实验室检测指标等因素对检测结果开展综合判断。
2.警示及注意事项:该试剂盒说明书中弄清楚了该试剂盒检验方法的局限性及使用中的注意事项。


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